Steered Molecular Dynamics Simulation of Kinesin Detachment from the Microtubule Surface

نویسندگان
چکیده

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

Unfolding of titin immunoglobulin domains by steered molecular dynamics simulation.

Titin, a 1-microm-long protein found in striated muscle myofibrils, possesses unique elastic and extensibility properties in its I-band region, which is largely composed of a PEVK region (70% proline, glutamic acid, valine, and lysine residue) and seven-strand beta-sandwich immunoglobulin-like (Ig) domains. The behavior of titin as a multistage entropic spring has been shown in atomic force mic...

متن کامل

Steered Molecular Dynamics

Steered molecular dynamics (SMD) induces unbinding of ligands and conformational changes in biomolecules on time scales accessible to molecular dynamics simulations. Time-dependent external forces are applied to a system, and the responses of the system are analyzed. SMD has already provided important qualitative insights into biologically relevant problems, as demonstrated here for application...

متن کامل

Molecular Dynamics Simulation of Al Energetic Nano Cluster Impact (ECI) onto the Surface

On the atomic scale, Molecular Dynamic (MD) Simulation of Nano Al cluster impact on Al (100) substrate surface has been carried out for energies of 1-20 eV/atom to understand quantitatively the interaction mechanisms between the cluster atoms and the substrate atoms. The many body Embedded Atom Method (EAM) was used in this simulation. We investigated the maximum substrate temperature Tmax  and...

متن کامل

the study of bright and surface discrete cavity solitons dynamics in saturable nonlinear media

امروزه سالیتون ها بعنوان امواج جایگزیده ای که تحت شرایط خاص بدون تغییر شکل در محیط منتشر می-شوند، زمینه مطالعات گسترده ای در حوزه اپتیک غیرخطی هستند. در این راستا توجه به پدیده پراش گسسته، که بعنوان عامل پهن شدگی باریکه نوری در آرایه ای از موجبرهای جفت شده، ظاهر می گردد، ضروری است، زیرا سالیتون های گسسته از خنثی شدن پراش گسسته در این سیستم ها بوسیله عوامل غیرخطی بوجود می آیند. گسستگی سیستم عامل...

Investigation of Melting by Molecular Dynamics Simulation

The melting of a 64 ion microcrystal of KCI was studied by means of a molecular dynamics computer simulation. We used a central pair interaction with an inverse power law repulsion. The thermodynamics, kinetic and structural properties such as melting temperature, latent heat, mean square displacement, diffusion constant, radial distribution function and bond angle distribution are calculated. ...

متن کامل

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: Biophysical Journal

سال: 2011

ISSN: 0006-3495

DOI: 10.1016/j.bpj.2010.12.1278